百度螺旋桨RNA结构预测

发布时间:2023-07-18 16:15:21    来源:

 

题目名称

百度螺旋桨RNA结构预测

作品形式

算法模型

赛题简介

核糖核酸(Ribonucleic Acid),简称RNA,在遗传编码、翻译、调控、基因表达等过程中发挥传递遗传信息和调控基因表达的作用

“RNA碱基不成对概率衡量了RNA序列在各个点位是否能形成稳定的碱基对(base pair),是RNA结构的重要属性,并可被应用在mRNA疫苗序列设计、药物研发等领域。

本赛题基于百度研究院发布的世界上最快的RNA二级结构预测算法LinearFold和世界上最快的RNA配分方程算法LinearPartition要求参赛者构建一个模型并预测RNA碱基不成对概率(unpaired probability),必须使用官方提供的训练集数据训练模型

型输入: RNA序列和LinearFold预测的该RNA对应二级结构;模型输出: 一个长度与RNA序列长度相等的向量,向量中每个数位表示对应点位碱基不成对概率(注意:概率值需要在0~1之间)。

本次竞赛旨在借助百度在RNA生物计算方向上的算法优势,通过百度大脑AI Studio平台,诚邀全球范围内计算生物、人工智能等领域从业者、爱好者和高等院校老师学生报名参赛,推动人工智能技术在生物计算上的技术应用。

关联数据资源

RNA结构预测数据(直接下载)
https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/219978

事组织方百度为参赛选手提供了训练数据集测试数据集 ,具体介绍如下:

训练数据集: 包括RNA序列 + LinearFold预测结构(模型输入)和 RNA碱基不成对概率标签(模型输出);
测试数据集: 包括RNA序列(模型输入)。

本届新题

出题单位

百度在线网络技术(北京)有限公司

联系人

刘聪琳

联系电话

18391314496

联系邮箱

liuconglin@baidu.com